MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017167	CGG	2	6	44730	44735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133828
1002	NC_017167	AGA	2	6	44742	44747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133828
1003	NC_017167	CAGC	2	8	44755	44762	25 %	0 %	25 %	50 %	384133828
1004	NC_017167	ACCC	2	8	44785	44792	25 %	0 %	0 %	75 %	384133828
1005	NC_017167	CCG	3	9	44796	44804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133828
1006	NC_017167	GAT	3	9	44881	44889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133828
1007	NC_017167	GCC	2	6	44990	44995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133828
1008	NC_017167	CCA	2	6	45021	45026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133828
1009	NC_017167	CG	3	6	45084	45089	0 %	0 %	50 %	50 %	384133829
1010	NC_017167	CCGTC	2	10	45090	45099	0 %	20 %	20 %	60 %	384133829
1011	NC_017167	GCT	2	6	45113	45118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1012	NC_017167	CG	3	6	45119	45124	0 %	0 %	50 %	50 %	384133829
1013	NC_017167	CCA	2	6	45140	45145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133829
1014	NC_017167	CGA	2	6	45149	45154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1015	NC_017167	GCGAT	2	10	45175	45184	20 %	20 %	40 %	20 %	384133829
1016	NC_017167	GCCTT	2	10	45232	45241	0 %	40 %	20 %	40 %	384133829
1017	NC_017167	TC	3	6	45334	45339	0 %	50 %	0 %	50 %	384133829
1018	NC_017167	CTG	2	6	45366	45371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1019	NC_017167	CGGG	2	8	45410	45417	0 %	0 %	75 %	25 %	384133829
1020	NC_017167	CG	3	6	45462	45467	0 %	0 %	50 %	50 %	384133829
1021	NC_017167	GCCGC	2	10	45480	45489	0 %	0 %	40 %	60 %	384133829
1022	NC_017167	GCC	2	6	45500	45505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133829
1023	NC_017167	ATG	2	6	45520	45525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133829
1024	NC_017167	CGAA	2	8	45539	45546	50 %	0 %	25 %	25 %	384133829
1025	NC_017167	CGG	2	6	45608	45613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133829
1026	NC_017167	GA	3	6	45614	45619	50 %	0 %	50 %	0 %	384133829
1027	NC_017167	CG	3	6	45663	45668	0 %	0 %	50 %	50 %	384133829
1028	NC_017167	CGC	2	6	45740	45745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133829
1029	NC_017167	CCG	2	6	45788	45793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133829
1030	NC_017167	GGC	2	6	45844	45849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133829
1031	NC_017167	GCA	2	6	45860	45865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1032	NC_017167	GCG	2	6	45902	45907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133829
1033	NC_017167	GC	3	6	45946	45951	0 %	0 %	50 %	50 %	384133829
1034	NC_017167	TGA	2	6	46001	46006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133829
1035	NC_017167	GC	3	6	46034	46039	0 %	0 %	50 %	50 %	384133829
1036	NC_017167	GAT	2	6	46041	46046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133829
1037	NC_017167	AAC	2	6	46051	46056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133829
1038	NC_017167	GAG	2	6	46077	46082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133829
1039	NC_017167	TCG	2	6	46093	46098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1040	NC_017167	CG	3	6	46109	46114	0 %	0 %	50 %	50 %	384133829
1041	NC_017167	GCT	2	6	46148	46153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1042	NC_017167	CGC	2	6	46231	46236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133829
1043	NC_017167	GCC	2	6	46263	46268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133829
1044	NC_017167	GAC	2	6	46284	46289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1045	NC_017167	ATGCCG	2	12	46339	46350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1046	NC_017167	CG	3	6	46364	46369	0 %	0 %	50 %	50 %	384133829
1047	NC_017167	CAG	2	6	46425	46430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133829
1048	NC_017167	TCA	2	6	46445	46450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133829
1049	NC_017167	GCG	2	6	46631	46636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017167	CG	3	6	46635	46640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_017167	GCC	2	6	46646	46651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_017167	GGT	2	6	46674	46679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133830
1053	NC_017167	CGTC	2	8	46730	46737	0 %	25 %	25 %	50 %	384133830
1054	NC_017167	GCG	2	6	46763	46768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133830
1055	NC_017167	GTT	2	6	46782	46787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133830
1056	NC_017167	GTT	2	6	46800	46805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133830
1057	NC_017167	CGC	2	6	46808	46813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133830
1058	NC_017167	TGA	2	6	46886	46891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133830
1059	NC_017167	GCC	2	6	46983	46988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133830
1060	NC_017167	GAT	2	6	47001	47006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133830
1061	NC_017167	GCCG	2	8	47046	47053	0 %	0 %	50 %	50 %	384133830
1062	NC_017167	TCG	2	6	47056	47061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133830
1063	NC_017167	CGA	2	6	47081	47086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133830
1064	NC_017167	CTG	2	6	47121	47126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133830
1065	NC_017167	CGGG	2	8	47150	47157	0 %	0 %	75 %	25 %	384133830
1066	NC_017167	CCAC	2	8	47167	47174	25 %	0 %	0 %	75 %	384133830
1067	NC_017167	GTT	2	6	47193	47198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133830
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1069	NC_017167	GAT	2	6	47213	47218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133830
1070	NC_017167	CGA	2	6	47237	47242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133830
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1072	NC_017167	GTC	2	6	47313	47318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133830
1073	NC_017167	GAT	2	6	47319	47324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133830
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1082	NC_017167	GAC	2	6	47650	47655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133830
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1084	NC_017167	ACG	2	6	47677	47682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133830
1085	NC_017167	GCGGCC	2	12	47686	47697	0 %	0 %	50 %	50 %	384133830
1086	NC_017167	TGA	2	6	47737	47742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133830
1087	NC_017167	TGC	2	6	47779	47784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133831
1088	NC_017167	TCG	2	6	47830	47835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133831
1089	NC_017167	G	6	6	47958	47963	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017167	CCG	2	6	47964	47969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_017167	GCG	2	6	47971	47976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017167	CAC	2	6	48037	48042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_017167	CGA	2	6	48102	48107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017167	CGTGG	2	10	48110	48119	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_017167	CCA	2	6	48186	48191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133832
1096	NC_017167	TGG	2	6	48278	48283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133832
1097	NC_017167	ACG	2	6	48409	48414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133832
1098	NC_017167	CAA	2	6	48417	48422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133832
1099	NC_017167	AGA	2	6	48425	48430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133832
1100	NC_017167	AGC	2	6	48511	48516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133832
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1102	NC_017167	CCA	2	6	48581	48586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133832
1103	NC_017167	GAA	2	6	48612	48617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133832
1104	NC_017167	CGT	2	6	48681	48686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133832
1105	NC_017167	GC	3	6	48712	48717	0 %	0 %	50 %	50 %	384133832
1106	NC_017167	GCC	2	6	48736	48741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133832
1107	NC_017167	GCC	2	6	48757	48762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133832
1108	NC_017167	CTC	2	6	48780	48785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133832
1109	NC_017167	CG	4	8	48814	48821	0 %	0 %	50 %	50 %	384133832
1110	NC_017167	GCG	2	6	48870	48875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133832
1111	NC_017167	GAA	2	6	48879	48884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133832
1112	NC_017167	CAC	2	6	48897	48902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133832
1113	NC_017167	GAG	2	6	48903	48908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133832
1114	NC_017167	ATC	2	6	48919	48924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133832
1115	NC_017167	GC	3	6	48925	48930	0 %	0 %	50 %	50 %	384133832
1116	NC_017167	TGA	2	6	48995	49000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133832
1117	NC_017167	CAT	2	6	49014	49019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133832
1118	NC_017167	CAT	2	6	49044	49049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133832
1119	NC_017167	ATG	2	6	49066	49071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133832
1120	NC_017167	CAC	2	6	49082	49087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133832
1121	NC_017167	TGG	2	6	49181	49186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133832
1122	NC_017167	TTC	2	6	49198	49203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133832
1123	NC_017167	GAT	2	6	49245	49250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133832
1124	NC_017167	TCGGCA	2	12	49295	49306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384133832
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1126	NC_017167	CAGC	2	8	49380	49387	25 %	0 %	25 %	50 %	384133832
1127	NC_017167	TCG	2	6	49408	49413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133832
1128	NC_017167	ATG	2	6	49545	49550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133833
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1130	NC_017167	CGT	2	6	49587	49592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133833
1131	NC_017167	AAGG	2	8	49596	49603	50 %	0 %	50 %	0 %	384133833
1132	NC_017167	AC	3	6	49631	49636	50 %	0 %	0 %	50 %	384133833
1133	NC_017167	CAG	2	6	49713	49718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133833
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1135	NC_017167	CAA	2	6	49805	49810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133833
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1147	NC_017167	CG	3	6	50550	50555	0 %	0 %	50 %	50 %	384133834
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1171	NC_017167	GC	3	6	51815	51820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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